Когда вы скачиваете файл на Windows - браузер и система проверяют ваш файл на вирусы и репутацию.
Хотите быть доверенным - надо покупать Extended Validation (EV) Code Signing Certificate за много денег, но его мало просто купить, с ним много тонкостей, о которых дальше и пойдет речь и о том как я потратил больше 4к долларов!