Как стать автором
Обновить
  • по релевантности
  • по времени
  • по рейтингу

Personal Genome Project: учёные раскрывают свои ДНК для всего мира

Биотехнологии
С шокирующим пренебрежением к собственной приватности как минимум 10 человек уже согласились выложить в открытый доступ собственные ДНК для расшифровки и анализа. Это учёные и компьютерщики из Гарварда, Дьюка и других американских университетов. Все они выслали по кусочку своей кожи и согласились на открытую публикацию данных анализа.

Таковы условия нового проекта Personal Genome Project, в рамках которого планируется привлечь к аналогичным действиям как минимум 100 000 человек и составить огромную открытую базу человеческих генотипов. Предполагается, что создание такой базы ускорит разработку новых лекарств и научно-исследовательскую работу генетиков. Собственно, с этим фактом соглашаются все в научном сообществе: чем больше такой информации будет в открытом виде, тем быстрее пойдут исследования.

Анализ ДНК на самом деле может дать человеку огромное количество информации о его собственном здоровье (человек может узнать о своей предрасположенности к ожирению, алкоголизму, раку, болезни Альцгеймера и сотням других болезней), а в некоторых случаях даже спасти ему жизнь. Например, недавно Сергей Брин (основатель компании Google) сделал анализ и теперь знает, что ему грозит смертельная болезнь. По крайней мере, у него есть пара десятилетий, чтобы подготовиться.
Читать дальше →
Всего голосов 34: ↑33 и ↓1 +32
Просмотры702
Комментарии 47

Google собирается создать генетически-молекулярную карту абсолютно здорового человека

Medgadgets


Корпорация Google, а точнее, ее подразделение Google X, запустила новый, достаточно интересный проект: создание базы данных из тысяч образцов генов и молекулярных структур различных людей, для построения «карты» абсолютно здорового человека. Базой будут служить образцы генома/тканей 175 человек, первых добровольцев, а чуть позже компания добавит еще тысячи новых образцов.

Проект получил название Baseline Study, и его единственная цель в настоящее время — показать всем нам, что же такое абсолютное здоровье.

Команда проекта будет собирать огромное количество информации, которая, по мнению авторов проекта, поможет в будущем определять заболевание по взятому образцу, благодаря паттерну/индикатору определенного заболевания. Такие паттерны специалисты смогут получить после обработки всей полученной в ходе проекта информации. А это десятки и сотни тысяч образцов генетического материала, взятого у тысяч и тысяч добровольцев.

Читать дальше →
Всего голосов 48: ↑46 и ↓2 +44
Просмотры21.9K
Комментарии 38

Алгоритмические задачи в биоинформатике. Лекция в Яндексе

ЯндексАлгоритмыМашинное обучение
Мы уже несколько раз упоминали серию мероприятий Data & Science, где специалисты по анализу данных и учёные рассказывают друг другу о своих задачах и ищут способы для взаимодействия. Одна из встреч была посвящена биоинформатике. Это отличный пример отрасли, где есть масса ещё не решённых задач для разработчиков.



Под катом вы найдёте расшифровку лекции Игната Колесниченко — выпускника мехмата МГУ и Школы анализа данных. Сейчас Игнат работает ведущим разработчиком службы технологий распределённых вычислений Яндекса.

Читать дальше →
Всего голосов 53: ↑48 и ↓5 +43
Просмотры13.5K
Комментарии 0

Google активно продвигает «Google Drive для генетиков»

Научно-популярноеБиотехнологииIT-компании


Корпорация Google предлагает научным лабораториям при университетах и больницам, да и всем научно-исследовательским организациям хранить информацию генетического характера в облаке. При этом само облачное хранилище, Google Genomics, было создано еще в марте этого года. Тем не менее, большое количество анонсов других сервисов и проектов отодвинуло Google Genomics на задний план.

Цель системы, по словам авторов Google Genomics «интерактивное исследование генетических вариаций». Это означает возможность доступа к информации о миллионах геномов для тысяч исследователей.

Читать дальше →
Всего голосов 25: ↑22 и ↓3 +19
Просмотры6.5K
Комментарии 2

ДНК в «облаке»: гигантская база геномов людей — будущее медицины

Научно-популярноеБиотехнологииМедгаджеты


Ной — 6-летний мальчик, который страдает заболеванием, названия для которого просто нет. В этом году его врачи начнут рассылать генетическую информацию Ноя в различные медицинские учреждения по всему миру, надеясь идентифицировать заболевание, найдя кого-то, кто страдает от такого же заболевания. При этом Ною становится все хуже, поэтому нужно действовать быстро, чтобы найти хоть что-то, что может помочь в идентификации болезни и ее возможном лечении. Если найти схожий случай не удастся, то надежды на успех нет.

Этот случай — один из многих, где требуется взаимодействие врачей в вопросе поиска и сравнения генотипов различных людей. Для работы нужна надежная система, позволяющая быстро искать и сравнивать генотипы. И такая система, возможно, скоро появится: в январе программисты из Торонто начали тестировать систему по обмену генетической информацией между больницами и другими медицинскими организациями. Система уже получила название MatchMaker Exchange, и пока ее главная цель — налаживание взаимодействие между медиками различных стран, которые занимаются проблемой редких генетических мутаций в одном-единственном гене.
Читать дальше →
Всего голосов 13: ↑13 и ↓0 +13
Просмотры6.6K
Комментарии 1

Генетики определили родину первых собак

Научно-популярноеЭкология


Собаки — друзья человека. Это утверждение верно уже многие тысячи лет. Но как появились собаки, и где человек начал с ними дружить впервые? Коллектив ученых из разных стран смог прояснить этот вопрос. Для того, чтобы дать четкий ответ, ученые решили проанализировать генотип современных собак.

Руководителем команды стал шведский генетик Петер Саволайнен ((Peter Savolainen), который уже около 15 лет пытается выяснить, откуда же родом наши любимцы. Обычным способом, путем поиска ископаемых, считает ученый, ничего добиться нельзя, поскольку данные, получаемые археологами, достаточно фрагментарные. Поэтому необходимо взять источник информации, который до недавнего времени (относительно, конечно) был ученым недоступен — это ДНК животных.
Читать дальше →
Всего голосов 13: ↑12 и ↓1 +11
Просмотры10.4K
Комментарии 7

Ученые из Нидерландов подтвердили: второй информационный слой в ДНК существует

Dronk.RuНаучно-популярноеБиотехнологии
Последовательность чередования оснований, определенная в молекуле ДНК, находящихся в каждой клетке нашего тела делает нас с вами такими, как мы есть. Вместе с тем, ряд ученых уже достаточно продолжительное время изучают возможность и вероятность существования «альтернативного» скрытого языка, также кодирующего жизненно важную информацию генома но другим способом и на другом уровне. Эта закодированная информация должна служить своего рода руководством к действию, используя которое клетки нашего организма получают возможность распознать и обработать основной массив информации в строго определенной последовательности.

image
Подробнее
Всего голосов 63: ↑43 и ↓20 +23
Просмотры29.6K
Комментарии 77

Биологи из Токийского университета выяснили причину неуязвимости тихоходок

Научно-популярноеБиотехнологии


Крохотные живые организмы, которых называют «тихоходками» хорошо известны в научной среде своей нечувствительностью к внешним факторам. Высокая или низкая температура? Не проблема, тихоходки выживают в невероятно сложных условиях, когда погибают даже самые стойкие микроорганизмы.

Впервые тихоходку описал немецкий пастор И.А. Гёце, назвав ее «маленьким водяным медведем». Современное название эти существа получили в 1777 году благодаря итальянскому ученому Спалланцани.
Читать дальше →
Всего голосов 51: ↑49 и ↓2 +47
Просмотры142.6K
Комментарии 96

Подбор экипировки игровому персу при помощи генетики/эволюции на Python

PythonМашинное обучениеИгры и игровые приставки
Как подобрать лучшую экипировку в любимой игре? Конечно, можно банально перебрать все её возможные сочетания (например, для разбойника из World of Warcraft) и найти наилучшее. Без всякой магии и машинного обучения. Но можно ли добиться этого результата не «в лоб», а при помощи генетических алгоритмов, не примеряя каждую комбинацию? Интересно узнать, как размножаются и эволюционируют разбойники? Поехали.

image
Читать дальше →
Всего голосов 9: ↑9 и ↓0 +9
Просмотры3.2K
Комментарии 4