А не планируется всю эту магию «само определит и настроить», довести до ума? А то как-то странно выглядит — создали эталонный пустой проект, и уже какие-то ошибки полезли, которые нужно затыкать powershell-скриптами.
причина ошибок в статье описывается, к проекту они отношения не имеют, это настройка билд сервера. Будет ли шаг «добавить dnx» встроен в будущем — не знаю, может быть
Готовим ASP.NET 5, выпуск №6: Continuous Deployment с Visual Studio Team Services — полное руководство