Pull to refresh
15.2
Karma
41.7
Rating
Самир @biolog_snork

Биолог

Страшные волосатики, или посмертный кошмар кузнечика

Popular science

Волосатики — это тип, как правило, паразитоидных животных клады нематоид. Данные существа являются очень милыми свободно живущими червячками внешне похожими на нематод. Правда свободно живущими они являются только на взрослой стадии развития, потому-то их и называют паразитоидами. 

Читать далее
Total votes 25: ↑22 and ↓3 +19
Views7K
Comments 10

Галлюцинации у мышей и как это связано с сумасшествием у людей?

Popular science

Лабораторные мыши являются маленькими друзьями учёных. Данные полученные в процессе изучения их поведения сильно приближают нас к пониманию многих эволюционных процессов происходящих в мире живых существ. Мы можем изучать природу происхождения различных болезней, например, таких, как рак [1], или можем проследить эволюционные связи мозга [2] млекопитающих и человека на основе мышиных моделей. Сегодня я как раз хочу поговорить о мышином мозге и мозге человека, важными результатами работы которых, является конечный продукт в виде различных форм разума [3;4].

Читать далее
Total votes 7: ↑6 and ↓1 +5
Views1.9K
Comments 13

Мясо из пробирки в меню заказывали?

Popular scienceBiotechnologies

Каждый из нас наверно задумывался о физическом страдании животных, которых мы едим. Далеко не всегда эти животные содержатся в должных условиях, удовлетворяющих пяти свободам животных, о которых я писал ранее [1]. Плюсом ко всему в связи с увеличением коровьего бешенства [4], люди опасаются появление массовой пандемии этого недуга и в своей популяции. 

Читать далее
Total votes 28: ↑23 and ↓5 +18
Views6.2K
Comments 205

Испытывают ли боль беспозвоночные?

Popular science

Боль - это негативное аффективное состояние, возникающее в результате повреждения или воспаления тканей. Поскольку боль вызывает сильные не приятные ощущения сравнимые с отвращением, то облегчение от природы её возникновения является полезным для животного. Животные стараются избегать ситуации, в которых они могут испытывать боль, а если они всё-таки её испытали, то они стараются ретироваться в такие места, где смогут получить облегчение от боли.

Читать далее
Total votes 29: ↑27 and ↓2 +25
Views8.4K
Comments 156

Краткая история мамонтенка Димы

Popular science

Однажды, в далёком 1977 году, июньским днём в верховьях реки Колымы на территории Магаданской области, не покладая рук и не жалея сил бравые товарищи с лопатами и не менее бравые сотоварищи рабочие бульдозеристы из старательской артели под звучным названием «Знамя», расчищали площадку для промывки золота во имя светлого, великого и прекрасного будущего советского коммунизма [1].

Читать далее
Total votes 32: ↑24 and ↓8 +16
Views7.6K
Comments 26

Предки митохондрий были паразитами?

Popular science

Митохондрии - это эукариотические органеллы, которые когда-то давно были бактериями. Конечно кто-то может возразить, что это всего лишь гипотеза, однако эта гипотеза уже давно переросла в эндосимбиотическую теорию и является общепринятой в кругах учёных.
Так уже давно считается, что митохондрии произошли когда-то от альфа-протеобактерий, вероятно, два миллиарда лет назад.

Читать далее
Total votes 26: ↑23 and ↓3 +20
Views9.2K
Comments 30

Действительно ли кистепёрая рыба именуемая латимерией является живым ископаемым, или это всё-таки заблуждение?

Popular science

Термин «живое ископаемое» был впервые введен Чарльзом Дарвином в его фундаментальном труде «О происхождении видов» в 1859 году. Ученый тогда обратил внимание на анатомическое строение утконосов и лепидосирен (вид двоякодышащих рыб). Он предположил, что эти животные в процессе эволюции морфологически изменяются очень медленно, ввиду отсутствия сильной конкуренции и резких изменений в окружающей среде.

Читать далее
Total votes 24: ↑24 and ↓0 +24
Views8.1K
Comments 21

Ещё раз про НАСА, которое покоряет Марс самым большим и современным марсоходом

Popular scienceAstronautics
Translation

Пока Рогозин отжигал мемчиками в соцсетях на тему американцев, которые обнаружили жизнь на Марсе в виде Рогозина, в это время самый большой и современный американский марсоход приземлялся на красной планете после 203-дневного путешествия. Данный марсоход преодолел 472 миллиона километров и отправил сигнал о успешном приземлении в центр управления полётами в Лаборатории реактивного движения НАСА, который находится где-то в Южной Калифорнии.

Читать далее
Total votes 34: ↑15 and ↓19 -4
Views8.8K
Comments 87

Проблема гуманного отношения к подопытным животным

Popular science

Лабораторные животные — это одомашненные животные, которые содержатся специально в качестве животных моделей для опытного эксперимента. Они являются биологическим сырьём для различных исследований и тестирований, различного обучения и производства биомедицинских материалов. Эти животные зачастую содержатся в специальных вивариях и служат модельными животными для заражения болезнями человека, или болезнями, которые могут передаваться от животных к человеку.

Существует методика проведения исследований на подопытных организмах. Эту методику можно разделить на две части:

1 часть. Техника Ex vivo, что с латыни означает за пределами жизни человека

Суть данной техники заключается в перенесении части тканей или органов из организма в искусственную внешнюю среду. При этом обычно используются живые клетки или ткани, извлечённые из живого организма и выращенные (или сохранённые) в стерильных лабораторных условиях в течение нескольких дней или недель в чашках Петри. Такие клетки в будущем изучаются In vitro (с лат. — «в стекле») т.е. «в пробирке» и служат образцами поведения организма в целом, как следствие — сокращается потребность в экспериментах над животными и человеком.

Читать далее
Total votes 26: ↑21 and ↓5 +16
Views4K
Comments 38

Он вам не нанотираннус! Не стоит обижать маленьких

Popular science

В 1946 году учёный палеонтолог Чарльз Уитни Гилмор просматривал найденные окаменелости тираннозавроидов (*) с целью дальнейшей их классификации и изучения. Блуждающий взгляд палеонтолога полного научного любопытства и энтузиазма, присущего великим учёным, исследователям и изобретателям пал на небольшой, но почти полный череп из Монтаны, который лежал среди многочисленных окаменелостей. Он и не догадывался, что этот череп принадлежал самому расхайпованному доисторическому хищнику, у которого впереди будет очень большая история открытий (рис.1).

Читать далее
Total votes 23: ↑23 and ↓0 +23
Views3.5K
Comments 8

Паутинные клещи и клещи-убийцы, запрограммированные летающие дроны и радостные люди

Popular science
Translation

Я долго думал, как соединить клещей, программирование и летающих дронов в одно целое пока не наткнулся на одно видео в интернете, где все эти три вещи объедены вместе. К сожалению, это видео на английском, но оно очень крутое, а потому я решаю донести его в виде русского текста здесь кратко и в доходчивой форме. Это больше обзор на видео, а не точный перевод слово в слово. Тем не менее смысл текста утерян не будет. Само же видео будет прикреплено в конце.

Начинается видео с представления нам главного антагониста, который приносит людям беды. Это двухпятнистый паутинный клещ (Tetranychus urticae), который является очень маленьким клещом размером с крупицу соли. Однако несмотря на свой маленький размер этот клещ имеет зверский аппетит, который делает его злейшим врагом фермеров во всем мире, так как данный клещ уничтожает посевы важных сортов растений, таких как например сочная клубника. Этих клещей можно легко узнать из тысячи подобных милейших созданий, обитающих на нашей планете, даже не видя их.

Дело всё в том, что после своего визита эти клещи оставляют визитную карточку в виде сухих и жухлых ржавого цвета листьев, покрытых паутиной в таком количестве, будто их покрыл монстр паук из фильма мгла. Только этот клещ не паук, хотя и относится к паукообразным, собственно как и все остальные клещи (рис.1).

Читать далее
Total votes 16: ↑7 and ↓9 -2
Views3.5K
Comments 5

Компьютерные технологии, молекулярная биология и биохимия. Как через синтез ДНК генерировать истинные случайные числа?

Network technologiesPopular scienceBiotechnologies

Объем надежно зашифрованной передачи данных, необходимый для сегодняшней сети «СКайНет», состоящей из транзакций, коммуникаций и взаимодействий людьми с компьютерами, телефонами, банковскими терминалами, постоянно увеличивается. Чтобы гарантировать безопасность схем шифрования и дешифрования для обмена конфиденциальной информацией, требуются большие объемы истинных случайных чисел.

 В своё время для этого были разработаны физические методы генерации случайных чисел, такие как лавовая лампа, разработанная Кремниевой долиной [1], и Mersenne Twister, так называемый программный ГСЧ [2]. Из современных ГСЧ есть такой Intel RNG [3], который обеспечивает пропускную способность аж в 500 МБ /с. Такие аппаратные ГСЧ создают потоки битов в зависимости от крайне непредсказуемых физических процессов, что делает их полезными для безопасной передачи данных, поскольку они менее подвержены криптоаналитическим атакам. Важно отметить различие между истинными ГСЧ и псевдо-ГСЧ. 

Истинный ГСЧ использует недетерминированный (хаотический) источник для генерации случайных чисел, тогда как псевдо-ГСЧ создает детерминированную последовательность чисел, которая зависит от ввода (начального числа) [4]. Если входное начальное число известно, можно воспроизвести всю последовательность случайных чисел. Однако псевдо-RNG могут иметь лучшие статистические свойства и часто могут генерировать случайные числа быстрее, чем истинные RNG, и, таким образом, они по-прежнему могут быть популярными [5]. 

Однако наука движется вперёд, хакеры не дремлют и старые способы могут рано или поздно кануть в лету. Собственно, по этой причине учёные и придумали новый метод с использованием знаний в бимолекулярной химии. Суть его заключается в использовании беспорядочной химической природы путем синтеза ДНК цепочек, состоящих из случайных нуклеотидов. Для этого учёные провели сравнение трёх независимо синтезируемых ДНК цепей в промышленности, которые показали надёжное распределение нуклеотидов в виде 7 миллионов ГБ случайных распределений в одном цикле синтеза, которые спокойно могут считываться с помощью современных технологий секвенирования со скоростью приблизительно 300 кБ/c. 

Читать далее
Total votes 5: ↑4 and ↓1 +3
Views1.1K
Comments 2

Медведи, хомяки, человекоподобные. Хомяк или медведь брат человеку с точки зрения биоинформатики?

Popular scienceBiotechnologies
Tutorial

Чтобы ответить на этот вопрос, в научном исследовании необходимо определиться с целью, задачами и методами, и изучаемыми материалами. Для этого нужно постараться предварительно поставить гипотезу, которая облегчит нам понимание того, чего мы хотим, а следовательно, позволит нам выбирать материалы исследования. В качестве гипотезы можно опираться на ваши знания в области классификации групп животных. Однако, если у Вас нет таких знаний и Вы не хотите страдать в поисках этих знаний в полях, лесах и лабораториях, то Вы можете стать продвинутым пользователем интернета и воспользоваться удобном сайтом lifemap [1], который отображает филогенетическое древо всех животных. Если же вы не продвинутый пользователь, то Вы можете просто воспользоваться википедией. Стоит отметить, что для учёного сайт Lifemap является таким же примитивным, как и википедия, но не бойтесь начать с малого, ведь википедия может послужить толчком к эволюции от простого к сложному. Поэтому пойдёмте эволюционировать на вики вместе. Для этого зайдём в поисковик и посмотрим информацию о нужных нам группах, с которыми в будущем нам предстоит работать, на данном сайте. Первые в списке у нас медвежьи. На странице сайта нам не нужно досконально изучать строение, размножение и образ жизни медведей. Нам нужны три вещи:

1) Раздел научной классификации.

2) Раздел филогенетики.

3) Краткая сводка классификации, которая отображена в верхнем правом углу под картинкой с научной классификацией.

Переходим в раздел научной классификации и смотрим список родов в семействе медведей, предварительно выписав название этого семейства на латыни (Ursidae). Нам понадобятся названия всех родов на латыни, которые есть в семействе. Их лучше также выписать.

Читать далее
Total votes 10: ↑9 and ↓1 +8
Views2K
Comments 3

Безобидные существа пережившие удар астероида, научились поедать всех на своём пути

Popular science

Когда 66 миллионов лет назад астероид врезался в Землю, в атмосферу попало огромное количество мусора, сажи и газов, которые погрузили планету в темноту, охладили климат и закислили океаны. Наряду с динозаврами на суше и гигантскими рептилиями в воде, были мгновенно истреблены около 90% основных продуцентов мелового периода в открытом океане, таких как кокколитофориды.

Кокколитофориды — сохранившаяся группа гаптофитных водорослей, характеризующихся известковыми оболочками клеточных стенок (коккосферами) и уникальной жгутиковой органеллой, называемой гаптонемой. Утрата их разнообразия и прекращение в глубоководных отложениях геохимического экспорта органического углерода на морское дно (биологический насос), свидетельствуют о разрушительных нарушениях продуцентов первого порядка экосистемы, за которой последовали каскадные вымирания более высоких трофических уровней.

Читать далее
Total votes 36: ↑29 and ↓7 +22
Views24.6K
Comments 32

Так ли безопасна российская вакцина от COVID -19? Мнение в поддержку вакцины

Popular scienceBiotechnologiesHealth

На начало ноября 2020 г. в мире было зарегистрировано 50 млн случаев COVID-19. Для формирования коллективного иммунитета, который должен был бы препятствовать возникновению повторных вспышек заболевания, этот показатель являлся явно недостаточным [1]. Карантинные мероприятия в нашей стране также порой вводятся с опозданием, что собственно подчеркнул и Премьер-министр Российской Федерации Михаил Мишустин [2]. Из этого следует, то что подобные меры не способны в полной мере ограничить распространение заболевания [1]. Поэтому вопрос о вакцинации части населения от новой коронавирусной инфекции до сих пор остаётся острым.

Тем не менее несмотря на скептическое отношение некоторых людей [10], наши учёные из Национального исследовательского центра эпидемиологии и микробиологии имени Н. Ф. Гамалеи первые в мире зарегистрировали двухкомпонентную вакцину от COVID-19, которая хоть и не безоговорочно [7], но успешно проявила себя в двух этапах и показывает в отличии от сходной оксфордской вакцины [4] объективную безопасность и эффективность в плане иммунного ответа на всех проходимых этапах [5]. Эффективность самой вакцины в целом мы окончательно увидим в конце третьего этапа в мае 2021 года [7].

Большинство критически негативных взглядов по по поводу этой вакцины , которые были ранее высказаны на хабре некоторыми аналитиками о скрытых исходниках [10], не правильных графиках и сомнительной эффективности были устранены в официальном ответе на критику Бучче [8] в международном журнале Lancet [9]. Единственный вопрос, который остался к вакцине это не полное прохождение второго этапа, о котором также высказался известный врач и популяризатор науки Алексей Водовозов [7]. Следует отметить, что он весьма объективно раскритиковал позицию некоторых аналитиков и представителей некоторых СМИ о похоронах российской вакцины, отметив также странным требование предоставить исходники [7].

Сам же Буччи, критикуя исследования о гамалеевской вакцине, отметил, что результаты этого исследования являются потенциально значимыми [8]. Поэтому если ко второму этапу всё таки и остаётся один вопрос по поводу объективной оценки эффективности, то по поводу безопасности вакцины, которая обычно проверяется на первом этапе вопросов нет, вопреки личным мнениям некоторых аналитиков на Хабре [10]. Безопасность этой вакцины также проверил на себе и на своей семье известный биолог Панчин Александр Юрьевич. При этом на себе он проверил действие этой вакцины два раза [3;11].

Читать далее
Total votes 66: ↑27 and ↓39 -12
Views17.3K
Comments 230

Как лечить диабет с помощью «пульта»?

Popular scienceBiotechnologiesHealth

Исследователи из Университета Айовы под руководством доктора медицинских наук, профессора лаборатории педиатрии, офтальмологии и визуальных наук медицинского колледжа UI Carver —Вэла Шеффилда и постдока лаборатории доктора наук Кэлвина Картера, вероятно, обнаружили новый безопасный способ в лечении сахарного диабета в результате исследования на мышах.

Согласно новым данным, опубликованным ими в октябре этого года, воздействие на больных диабетом мышей по средством электро-магнитных полей (ЭМП) в течение нескольких часов в день нормализует основные признаки диабета 2 типа в клеточном метаболизме, т.е. снижает уровень сахара в крови и нормализует реакцию организма на инсулин.

Читать далее
Total votes 14: ↑12 and ↓2 +10
Views2.1K
Comments 9

Вымирание современной мегафауны может привести к вероятному вымиранию манго в тропиках

Popular science

Несколько месяцев назад мы обсуждали такое интересное явление под названием эволюционные анахронизмы, с помощью которых мы постарались объяснить причину того, почему у авокадо такая большая косточка. Наш пост на эту тему авокадо был опубликован в замечательном портале антропогенез [2]. Тем не менее не все люди согласны с этой позицией и выражают критику данной гипотезы рассказывая нам о том, что мегафауна не могла и не может повлиять на выживаемость растений. От части они будут правы, но только в тех случаях, для которых доказано, что выживаемость семян не зависит/зависело в большей степени от мегафауны в виде вымерших мастодонтоподобных животных и нынешних тапиров, а также заменителей мегафауны в виде домашнего скота.

Так как эти семена вполне спокойно разносятся и без них с помощью крупных попугаев (например Ара) и разных макак, роль мегафауны с этой позиции остается весьма спорной и ставит под сомнение господствующее положение гипотезы эволюционных анахронизмов. Такими семенами могут быть крупные семена плодовых пальм произрастающих в Амазонии [1]. В тоже время последнее исследование этого года не опровергает роль эволюционных анахронизмов для некоторых растений нового света и для большинства растений старого света [4]. Подробнее об этом мы поговорим в другой раз, когда подвергнем критики гипотезу эволюционных анахронизмов.

Тем не менее с точки зрения гипотез выдвинутых нашими подписчиками и подписчиками портала «антропогенез», единственное на что может повлиять мегафауна — это максимум только на распространение семян. Ошибка заключается в том, что они совершенно не берут во внимание тот факт, что выживаемость семян зависит во многом от их распространения. Именно поэтому наши подписчики и подписчики паблика «антропогенез» с этой точки зрения ошибаются.

Сегодня я хочу рассмотреть вопрос о распространении семян растений, которые претендуют именно на роль эволюционного анахронизма [3]. Речь как вы поняли из названия пойдёт о растениях подобных манго, которые произрастают в лесах Восточной Азии и употребляются в пищу чаще всего носорогами, слонами и тапирами, где слоны и носороги являются главными представителями современной мегафауны, которые собственно и являются главными распространителями данных семян.

Читать далее
Total votes 8: ↑7 and ↓1 +6
Views3.4K
Comments 17

Внимание! Абсолютно доказано — щитни являются живыми ископаемыми

Popular science

Щитней, в частности щитней вида Triops cancriformis часто называют «живыми ископаемыми». Ранее в фанерозое я рассказывал о абсолютно доказанном живом ископаемом — коморской латимерии , чей генотип и морфология якобы практически не изменились за многие миллионы лет эволюции.

Щитни, в том числе щитни вида T. Cancriformis имеют похожую историю, ведь согласно русскоязычной википедии они не изменялись около 200 миллионов лет! Более того, именно этот вид щитней якобы обитал уже в позднем Триасе, о чём свидетельствовали остатки этого вида найденные учёными в отложениях возрастом в 237-200 миллионов лет [1].

Читать далее
Total votes 26: ↑14 and ↓12 +2
Views8.4K
Comments 32

Гигантский ленивец — первое домашнее животное?

Popular science

В конце 1895 г. на юге Чилийской Патагонии, в нескольких милях от побережья фьорда Ультима-Эсперанса, группой энтузиастов из шести человек, во главе с отставным немецким офицером Эберхардтом была обнаружена сеть пещер. В одной из этих пещер Эберхардт обнаружил свежую (как ему казалось) шкуру неизвестного животного, которую он оставил у себя в качестве трофея.

Материал был написан мной в научно-популярном сообществе https://vk.com/phanerozoi_ и позже появился на антропогенезе (https://vk.com/antropogenez_ru)

Спустя год он показал эту находку известному на тот момент времени шведскому путешественнику, Отто Норденшёльду, который, загоревшись идеей найти живого обладателя данной шкуры, отправился в ту же пещеру. Однако живого зверя он не нашёл, зато обнаружил в пещере кости каких-то странных гигантов, погибших, по его мнению, не так давно. (Рот, 1899, 1904; Леманн -Ницше, 1899, 1904).

Читать далее
Total votes 39: ↑36 and ↓3 +33
Views8.2K
Comments 37

Биоинформатика на минималках. Почему блохи родственники ледничков?

Popular scienceBiotechnologies

Актуальность тренировки. 

Важный этап в развитии классификации отряда блох связан с развитием генномолекулярных исследований. В настоящее время благодаря этим методам подтверждается родственность отрядов блох и мекоптер. Активно изучаются гены рибосомальной ДНК, фактор элонгации белкового синтеза и митохондриального гена цитохромоксидаза II (COII), которые изучены у представителей большинства семейств отряда мекоптер, а также 128 видов 83 родов блох из 16 семейств (С.Г. Медведев.2009; Whiting 2002; Whiting et al. 2008). На основе данных по этим генам различными методами построения филогенетических деревьев и моделями подсчёта попарных расстояний реконструируется филогения блох, представленная за частую в виде консенсусного древа (strick consensus) (Whiting et al. 2008). Однако, в ряде случаев, результаты генномолекулярных исследований противоречат схеме родственных связей, полученных на основе филогенетического анализа. К тому же в соответствии с различными трактовками молекулярно-генетических данных могут по-разному трактоваться происхождения ключевых инфраотрядов блох. Так с точки зрения разных авторов одни и те же клады блох могут являться как полифилетическими, так и монофилетическими группами (Whiting et al. 2008, С.Г. Медведев.2019). Это может быть связано как с особенностями экологии современной фауны блох, так и с разного рода методическими проблемами работы с молекулярно-генетическими данными. В отношение первого пункта следует подчеркнуть, что обособление отдельных филетических линий блох, имеющих равный статус в таксономии, происходило в разные исторические промежутки времени. Это в свою очередь означает, что фауна блох являет собой разрозненные фрагменты обширной палеофауны, к настоящему моменту в значительной степени вымершей (С.Г. Медведев.2009, С.Г. Медведев.2019). Из этого следует, что при разных методических подходах к генно-молекулярным исследованиям мы можем упустить из вида конвергентную эволюцию нуклеотидных последовательностей (гомоплазия), что может привезти к ошибкам в определении топологии дерева и к низкой статистической поддержке ветвей. Так, например, используя данные, которые имеют разное отношение для разных таксонов и соответственно разное отношение к разным участкам генов, мы обнаружим пробелы в последовательностях, и отсутствие данных по разным локусам для разных образцов (С.Г. Медведев.2019, Лукашов В.В. 2006). Поэтому при выборе метода исследования следует учитывать все эти проблемы и подбирать образцы наиболее изученных и распространённых таксонов блох, чтобы потом сравнить их с наиболее изученными образцами мекоптер. Таким образом мы сможем построить более достоверное дерево с высокой поддержкой.

Читать далее
Total votes 21: ↑14 and ↓7 +7
Views2K
Comments 14
1

Information

Rating
132-nd
Location
Санкт-Петербург, Санкт-Петербург и область, Россия
Date of birth
Registered
Activity