Pull to refresh

Смертность, летальность, коронавирус и матан

Reading time5 min
Views27K
Для начала, давайте разберемся с двумя важнейшими эпидемиологическими понятиями: смертностью и летальностью. Сразу оговорюсь, что в википедии (как русской, так и английской) приведено ошибочное определение летальности, которое сбивает с толку.

Летальность — это вероятность умереть, если у пациента диагностирована болезнь. Вот цитата из научной статьи:
one of the most important epidemiologic quantities to be determined is the case fatality ratio—the proportion of cases who eventually die from the disease.

Смертность — это отношение числа умерших от болезни к размеру популяции за какой-то промежуток времени. Обычно, считают сколько смертей на 100 тыс. населения за единицу времени. Смертность непосредственно связана с летальностью: это произведение вероятности заболеть (за определенный временной период) на летальность. В самом деле, для того, чтобы умереть от болезни надо сначала ей заразиться, а потом уж, если не повезет…
Читать дальше →
Total votes 54: ↑42 and ↓12+30
Comments45

Коронавирус: почему надо действовать прямо сейчас

Reading time19 min
Views5.6M

Вступление


Учитывая всё, что происходит с коронавирусом, может оказаться очень сложно принять решение, что делать прямо сейчас. Стоит ли подождать, пока станет больше информации? Надо ли предпринять что-то уже сегодня? Если да, то что?

В этой статье со множеством графиков, данных и моделей из большого числа источников мы постараемся ответить на вопросы:

  • Сколько людей заболеют коронавирусом в вашем регионе?
  • Что случится, когда они начнут заболевать?
  • Что вы должны делать?
  • Когда?

Когда вы закончите читать статью, вы придёте к следующим выводам:

  • Коронавирус приближается к вам.
  • Он приближается с экспоненциальной скоростью: сперва постепенно, а потом внезапно.
  • Это вопрос нескольких дней. Может быть, неделя или две.
  • Когда это случится, ваша система здравоохранения будет перегружена.
  • Ваши сограждане будут лечиться в коридорах.
  • Изможденные медицинские работники сломаются. Некоторые погибнут.
  • Им придётся решать, кто из пациентов получит лечение, а кто умрет.
  • Единственный способ предотвратить это — социальная изоляция уже сегодня. Не завтра. Сегодня.
  • Это значит держать как можно больше людей дома, начиная с сегодняшнего дня.

Если вы политик, общественный деятель или руководитель, у вас есть власть и ответственность, чтобы предотвратить описанное выше.

Сейчас вы можете опасаться: что, если это избыточная реакция? Не станут ли люди смеяться надо мной? Вдруг они разозлятся на меня? Не буду ли я выглядеть глупо? Не лучше ли подождать, пока другие сделают первые шаги? Что, если это слишком навредит бизнесу?

Однако через 2-4 недели, когда весь мир будет закрыт и изолирован, когда окажется, что несколько драгоценных дней социальной изоляции, которые вы организовали, спасли жизни, вас больше не будут критиковать. Люди будут благодарить вас за то, что вы приняли правильное решение.

Итак, давайте разбираться.
Много графиков и длинный текст
Total votes 568: ↑512 and ↓56+456
Comments2074

Пытаемся разобраться с разительными различиями в уровне смертности от коронавируса в Италии и Южной Корее

Reading time5 min
Views94K
Первый подтверждённый случай коронавируса в Италии и Южной Корее примерно 20 января. Население — 60М в Италии, 51М — в Южной Корее.

На конец 11 марта 2020г. в Италии 12462 подтверждённых случае и 827 смертей, ~6.6%. В Южной Корее — 7755, 61, ~0.77%. (числа отсюда [1]).

В Италии ситуация хуже почти на порядок (в 8.5 раз). Но почему? Попробуем хотя бы частично разобраться.



Дисклеймер. Я — не медик и не биолог.

В рамках этого текста буду играть за математика с опытом биоинформатики.

Поэтому рассуждения могут оказаться не имеющими отношения к действительности. С другой стороны все факты будут подтверждены пруфлинками.

Если у вас есть факты с пруфлинками — жгите!
Total votes 50: ↑43 and ↓7+36
Comments72

Почему мы (возможно) завышаем летальность COVID-19

Reading time5 min
Views7.5K
! Внимание, я не врач, здесь изложено мое личное мнение. Этот пост НЕ предназначен для оценки ваших рисков и принятия каких-либо решений, касательно вашего здоровья!

Сейчас, когда все страны мира вводят так или иначе запретительные меры, самым важным является правильная оценка летальности болезни. К сожалению, этому почти не уделяется внимание, однако, именно этот фактор должен определять размах запретительных мероприятий. Бесконтрольное распространение карантина способно полностью парализовать мировую экономику (что мы уже наблюдаем) и ухудшить качество жизни и вложения в здравоохранение людей на целой планете. Существует распространенное мнение, что ПЦР диагностика показывает нам точную картину, однако это не так. ПЦР-диагностика — это лишь инструмент имеющий свои ограничения. Если к этому добавляется неправильная выборка в популяции, то мы будем видеть «погоду на Марсе» вместо хоть сколько-нибудь обоснованной оценки.
Читать дальше →
Total votes 49: ↑22 and ↓27-5
Comments77

Коронавирус: Возможные последствия для общества, экономики и медицины

Reading time26 min
Views41K
„То, что принято без доказательств, может быть отвергнуто без доказательств.“
— Эвклид.

Пост «Коронавирус: почему надо действовать прямо сейчас», как и оригинал перевода собрал много внимания аудитории по вполне понятным причинам. Поскольку всё в мире должно находиться в равновесии, то в рамках этого поста будет дана попытка представить ещё один взгляд на, уже всеобщую, проблему. Задача явным образом опровергнуть или разоблачить вышеприведённый пост не стоит. Каждый самостоятельно может сопоставить противоречащие утверждения.

Действительно, учитывая всё, что происходит с коронавирусом, может оказаться очень сложно принять решение, что делать прямо сейчас. Стоит ли подождать, пока станет больше информации? Надо ли предпринять что-то уже сегодня? Если да, то что?

К сожалению, суждения очень многих, в настоящее время приобретают характер веры. Тем не менее, всем, кто действительно имеет желание понимать природу явления этот материал может дать пищу для размышлений или задать направление для собственных исследований, чтоб помочь детальней разобраться в непростой ситуации и иметь больше шансов для взвешенных решений.

В этом видео со множеством графиков, данных и моделей автор постарается ответить на многие вопросы:

  • Какова природа вирусных заболеваний? 3:30
  • Каков существующий масштаб ущерба от вирусных заболеваний, когда об этом не было принято повсеместно говорить?
  • Какова механика и специфика распостранения острых вирусных респираторных заболеваний и коронавируса в частности? 17:30
  • Для кого коронавирус представляет опасность? 23:00
  • Как корректно считать и оценивать смертность, летальность и каковы эти значения для коронавирусной инфекции? 30:00
  • Какова связь между заразностью и смертностью вирусных инфекций? 35:00
  • Про маски. 50:00
  • Ретроспективный разбор действий Китая и о пользе карантина. 53:00


Total votes 74: ↑46 and ↓28+18
Comments108

Коронавирус: как мы себя обманываем

Reading time11 min
Views692K
Я прекрасно понимаю, что степень истерии на фоне коронавируса привела общество к конфликту между последователями и отрицателями всеобщей паники. Достаточно острая групповая поляризации не вызывала особого желания излагать свою точку зрения на широкую публику. Но когда меня всюду начали преследовать конспирологические теории и бездумные толкования данных, то я понял, что утешающих аргументов очень мало и решил восполнить их дефицит.

Искажение смертности


Уверен для многих станет откровением факт того, что количество смертей при наличии коронавируса, зафиксированных в ВОЗ, не является числом смертей от коронавируса.

А как вы думали? Новая для человечества инфекция ещё до конца не изучена, но в больнице из пригорода какого-нибудь Ливорно уже умеют определять смерть от неё? Назвать причину смерти - это же не баг при компиляции отловить. Всё гораздо сложнее.

Есть заключительный клинический диагноз. Основное заболевание может включать несколько нозологических форм. Существует понятие конкурирующих заболеваний, которыми одновременно страдал умерший и каждое из которых в отдельности могло привести к смерти.

Есть ещё заключение о причине смерти по результатам патологоанатомического вскрытия, а также случаи его расхождения с заключительным клиническим диагнозом, которые разрешаются экспертной комиссией.

Именно поэтому ВОЗ чёрным по белому пишет
Определение истинной смертности от COVID-19 требует дополнительного времени. Сегодняшние данные свидетельствуют о том, что общий коэффициент смертности составляет 3–4%, при этом уровень смертности от инфекции будет ниже.
Читать дальше →
Total votes 526: ↑336 and ↓190+146
Comments1049

Мой набор для автономного выживания во время карантина

Reading time16 min
Views36K

Эта статья посвящена подготовке к автономному выживанию в течение периода карантина. Судя по опыту ЕС и Китая, Украины и Беларуси, не за горами введение карантина из-за пандемии коронавируса Covid-19 и в РФ. Многие это уже поняли и начали заранее запасаться продуктами, средствами защиты органов дыхания, дезинфицирующими средствами и т.п. Не стал исключением и я. Эта статья подытоживает мой опыт в изучении СЗОД (средств защиты органов дыхания), разных режимах и стилях питания, составлении продуктовых раскладок для автономного выживания в течение длительного времени (у меня приличный опыт пеших, водных и горных походов длительностью 2-4 недели с составлением продуктовых раскладок на этот срок), подборе оптимальных продуктов для полноценного питания как по калориям, так и по нутриентам и балансу БЖУ (белки-жиры-углеводы) и в хранении этих продуктов в течение длительного времени. Постараюсь изложить все это простым языком, кратко и не перегружая лишней информацией.

Читать дальше →
Total votes 73: ↑41 and ↓32+9
Comments193

Коронавирус: Фиаско века в процессе творения? Как мы принимаем решения без достоверных данных

Reading time8 min
Views40K
Перевод статьи для профильного медицинского издания "STAT" в разделе "Мнения". Автор, Джон П.А. Иоаннидис (John P.A. Ioannidis) — профессор медицины, эпидемиологии и здоровья населения, биомедицинской науки и статистики Стэнфордского университета, со-директор Стэнфордского инновационного центра метаисследований.


COVID-19, уже называется «пандемией века». Но так же, может быть, это и самое масштабное «фиаско века».
Читать дальше →
Total votes 69: ↑52 and ↓17+35
Comments141

COVID-19: прогнозируем число больных коронавирусом

Reading time7 min
Views12K
Коронавирус окончательно захватил весь мир — и выражается это не в том, что им успел переболеть каждый житель планеты. На данный момент эта тема является главной и единственной — как в мировых, так и в российских новостях. В этой статье мы постараемся максимально абстрагироваться от политики и рассуждений о том, запустили ли вирус китайские военные, или же Дональд Трамп. Вместо этого мы посмотрим на проблему с математической точки зрения — а именно, выясним, как можно описать эпидемию одним уравнением, а в конце статьи предскажем итоговое число зараженных COVID-19 — в том числе в России.


Читать дальше →
Total votes 30: ↑13 and ↓17-4
Comments10

Чек-лист: как не потерять сотрудников, отправив их на удаленку

Reading time4 min
Views7.4K
Неожиданно удаленка стала востребована компаниями, которые совсем недавно заявляли, что никогда не будут экспериментировать в этом направлении. Мы в “Максилекте” работаем полностью удаленно с 2015 года. И специально для таких компаний в двух словах обобщили свой опыт.

Представляем перечень важных моментов, на которые стоит обратить внимание, отправляя сотрудников на самоизоляцию. Надеемся, это поможет быстро наладить рабочие процессы.

image
Читать дальше →
Total votes 11: ↑11 and ↓0+11
Comments2

Почему не стоит бояться коронавируса: мифы и почти правда о COVID-2019

Reading time20 min
Views171K
Очередная волна эпидемии коронавируса (теперь уже пандемии) принесла и очередную волну публикаций, посвященных опасностям нового вируса со страшными предсказаниями и графиками.

Поднявшаяся паника подействовала и на меня, но сопротивляясь ей из последних сил, я попытался найти для себя ответы на некоторые вопросы, которые обошли вниманием другие авторы, но кажутся мне важными, или хотя бы прояснить, действительно ли миру и мне угрожает смертельная опасность, и что с этим можно сделать.
Читать дальше →
Total votes 102: ↑85 and ↓17+68
Comments164

Почему тепловизоры не могут измерять температуру тела человека

Reading time18 min
Views25K


Спрос на тепловизоры в качестве инструмента, помогающего выявлять повышенную температуру, как один из симптомов коронавируса, резко возрос, поскольку коронавирус начал активно распространяться по всему миру.

Крупнейший в мире производитель тепловизоров FLIR, заявил, что его глобальный спрос увеличился на 700%. Все мгновенно почувствовали запах больших денег! Однако далеко не каждый тепловизор может изменять температуру тела человека.
Читать дальше →
Total votes 11: ↑9 and ↓2+7
Comments5

Руководство по выживанию при пандемии коронавируса, или что нужно делать сейчас

Reading time7 min
Views17K

В эту статью добавил полезные знания по коронавирусу, которые пока мало кому известны. Я не являюсь медицинским экспертом, но старался опираться на авторитетные источники. И это не реклама каких-то препаратов, а руководство по выживанию и защиты престарелых родственников.


image

Постановка проблемы


Мы отстаем по темпам заражения от Италии примерно на 1 месяц. Ожидается, что в апреле наступит коллапс системы здравоохранения, если не будут приняты жесткие карантинные меры, как в Китае. Подробнее смотри ниже. Поэтому пишу, что нужно купить и сделать прямо сейчас, пока не поздно из-за дефицита товаров. Это лучше, чем просто пассивно читать новости и опасаться мифов.


1. Что полезно сейчас купить в магазине от коронавируса, пока оно еще есть:


— Барьерное противовирусное средство – в нос. Судя по информации в интернете, у Назаваля Плюс доказана эффективность создания барьера против ОРВИ и аллергенов [1]. А вот у хваленой оксолиновой мази за 50 лет применения эффективность так до сих пор и не доказана судя по той же Википедии.


Читать дальше →
Total votes 66: ↑11 and ↓55-44
Comments58

Возможные сценарии распространения COVID-19

Reading time11 min
Views69K


Подперев голову рукой, я тоскливо следил за бесконечной лентой панических новостей, наблюдая за тревожными вестями из Италии, и ловил не менее неприятные слухи о возможности остановки транспорта у нас. Кто-то в комментариях активно распалялся: «Нужны ли все эти меры? Да как они помогут борьбе с вирусом?», другие призывали готовиться к худшему, третьи вообще отрицали угрозу. Хотелось более чётко и обоснованно понимать, что же происходит.

Уделив проблеме вечер, я решил ответить при помощи математики на следующие вопросы:

  • Эффективны ли принимаемые меры? Насколько?
  • Будет ли у нас как в Италии? Самое страшное всё ещё впереди?
  • Насколько вероятно сейчас встретить заражённого в транспорте?
  • Удастся ли полностью побороть новый вирус?

В итоге, я создал небольшую программу для моделирования (бинарник, исходник) и получил с её помощью результаты — обнадёживающие, но неоднозначные. За деталями — прошу под кат.
Читать дальше →
Total votes 124: ↑92 and ↓32+60
Comments203

Протокол лечения коронавируса 2019-nCoV природными веществами

Reading time1 min
Views9.3K


В этой короткой статье привожу список кандидатов лекарств уже имеющихся в аптеках, а также натуральных средств которые смягчают протекание болезни и лечат коронавирус Sars-cov 2.
Все средства подтверждены ссылками в пабмеде ( самая большая база научных публикаций — более 80 млн статей по биологии и медицине ). Средства выведены по исследованию генов экспрессия которых меняется в ответ на проникновение вируса в клетку хозяина.
Total votes 67: ↑2 and ↓65-63
Comments6

Почему карантин из-за COVID-19 — это все таки overreacting

Reading time4 min
Views20K
Обычно паника обратно пропорциональна информированности. В случае с вирусом SARS-CoV-2 не так: данные о его преувеличенной опасности публикуются, но уровень страха тем не менее продолжает расти. Очевидно, медиасреда самостоятельно продуцирует необходимые для поддержания тревожного состояния сообщения. Кроме того, большую роль играют интерпретации данных.

Риски


Вчера на новость об отмене Олимпиады в Токио в ФБ отреагировали так: правильно, иначе «для многих спортсменов Олимпиада, при такой эпидемии, может стать последней».

Очевидно, что в массовом сознании степень опасности вируса оценивается как высокая для каждого.

Один из основных источников данных об эпидемии — это американский университет Хопкинса. В статистических данных о заболевании COVID- 19 приводятся данные по смертности, полученные еще в Китае, но они по прежнему считаются актуальными, т.к. статья обновлена 23 марта.

image

Для взрослых людей до 40 лет смертность составляет 0,2%. Из них большинство смертей обусловлено сопутствующими причинами (сердечные и респираторные заболевания, рак).
Случаев не-обусловленных — 0,9%.
Читать дальше →
Total votes 153: ↑78 and ↓75+3
Comments411

Что в Белизне тебе моей или Справочное пособие по гипохлориту натрия («хлорке»)

Reading time31 min
Views214K
Не передать, насколько мне приятно это писать. Данная статья полностью профинансирована подписчиками канала LAB66. Ни один производитель описанных в тексте средств -  своего участия не проявил, так что никакой скрытой рекламы, чиcтый альтруизм и потребительский интерес :)

Сегодня читаем о самом простом, самом доступном и самом действенном антисептике — про гипохлорит натрия (он же «Белизна»). Совместимость с различными материалами, техника безопасности, свойства и эффективность не только против коронавируса, но и против страшной плесени и ее микотоксинов. В качестве «вишенки» — контрольная закупка магазинных отбеливателей и оценка их состава. Чтобы узнать как в эпоху пандемии нас дурят производители бытовой химии и прочий «менеджерский брат» — идем под кат. И обязательно закидываем в закладки. Эта информация пригодится еще не раз ;)


Даешь нормальную Белизну!
Total votes 179: ↑176 and ↓3+173
Comments73

Коронавирус — апофеоз паники

Reading time3 min
Views11K
На Хабре каждый день появляются статьи на тему Коронавируса, пандемии грандиозного информационного масштаба. На момент написания данной статьи в мире зафиксировано 616 680 случаев заражения и 28 818 летальных случаев, а население Земли составляет 7.5 миллиардов человек. В своей статье я совершенно не пытаюсь отрицать серьёзность самого заболевания, но хочу обратить внимание коллег на чрезмерное нагнетание ситуации правительствами и СМИ. История с Коронавирусом уже обрела формат настоящей истерии и я абсолютно уверен, что гораздо больше людей погибнет не от самого вируса, а от инфарктов и других заболеваний спровоцированных резко возросшим уровнем стресса. Текущий информационный поток служит не объективному информированию, а провоцированию такой эмоции как страх. Сцены с бронетехникой на улицах, люди сметающие продукты и товары первой необходимости вызывают волнение и у людей спокойных, а какой эффект всё это оказывает на стариков или впечатлительных людей трудно представить.
Читать дальше →
Total votes 86: ↑35 and ↓51-16
Comments78

Коронавирус: опасная иллюзия смертности

Reading time12 min
Views1M
Безответственная пресса начинает заполнять наше информационное поле новостями о погибших от коронавируса, хотя таких сведений не озвучивает ни лечащий врач, ни ВОЗ. Из-за своей невнимательности журналисты де-факто самостоятельно называют причины смерти. И эта маленькая неточность в формулировке имеет колоссальное значение для общества. Сегодня крайне важно не путать общую смертность людей с подтверждённым коронавирусом и смертность непосредственно от коронавируса.

Все мы видели пугающие цифры среди погибших с положительным тестом на Covid-19. Но высокий процент смертности, который мы наблюдаем — есть иллюзия, ибо в большинстве своём мы смотрим на естественную смертность, которая случилась бы и без заражения, поскольку причиной стало что-то другое. То есть смертность от инфекции как бы умножается на естественную, и мы лицезреем результат этого умножения, хотя нам надо смотреть на частное.

Говоря иносказательно, день смерти для каждого предопределён и множество людей с коронавирусом, ушедших в мир иной, умерли бы в любом случае. Мы не узнаем их количество, но можем посчитать риски, опираясь на теорию вероятностей. Для этого нам надо сопоставить общую смертность со смертностью при наличии инфекции.

В своей предыдущей статье «Коронавирус: как мы себя обманываем» я уже демонстрировал разницу между смертностями на примере демографических данных Италии по одной возрастной группе. А сейчас я хочу поделиться свежим графиком Дэвида Шпигельхальтера, именитого статистика из Университета Кембриджа. В его распоряжении был полный объём данных по Великобритании от Имперского колледжа Лондона.

Таблица с данными + те же значения на логарифмической шкале
Читать дальше →
Total votes 474: ↑246 and ↓228+18
Comments2163

О математике, пандемиях и карантинах, продолжение

Reading time5 min
Views17K
Начало здесь.

Disclaimer 1

Я математик, а не врач. По всем вопросам здоровья, коронавирусов и смысла жизни консультируйтесь с медиками, не будьте глупыми людьми.

Disclaimer 2

По этическим соображениям, результаты работы модели, калиброванной по параметрам COVID-19, публиковаться не будут. Возможно, вы с моим решением не согласны, но вам придется с этим жить.
Как мы увидели в прошлой части, режим самоизоляции достаточно эффективен, в частности он сбивает экспоненциальный рост числа заболевших до степенного и тем самым позволяет снизить нагрузку на здравоохранения до приемлемой (“flatten the curve”, ага). Тем не менее, режим самоизоляции длится очень долго, наносит огромный ущерб экономике и возникает резонный вопрос: нельзя ли обойтись пусть более жесткими, но краткосрочными мерами?

Для наглядности экспериментов я слегка модифицировал инфекционный агент, сделав его чуть менее заразным, для большей иллюстративности интересующих нас эффектов. Помимо этого, я снизил порог насыщения минздрава до 5% популяции (это все равно очень и очень много). И да, чтоб не слишком ранить чувствительные души, шанс смерти индивидуума, которому «не досталось койки», вырастает теперь в три раза, а не в десять, как раньше. Цените мой гуманизм! Остальные параметры такие же (самое важное: инкубационный период, когда пацак заразен, длится 10 дней и столько же длится период лечения).
Читать дальше →
Total votes 42: ↑37 and ↓5+32
Comments157