Pull to refresh

Сотрудники МТИ преобразовали структуру белка коронавируса в музыку

Reading time2 min
Views9.5K
image

Маркус Бюлер из Массачусетского технологического института, который специализируется на проектировании моделей ИИ для разработки новых белков и использует ультразвуковую обработку, применил этот подход для выявления вибрационных свойств белкового шипа SARS-CoV-2, ответственного за высокую скорость распространения коронавируса.

По словам Бюлера, иерархические элементы получившейся музыкальной композиции (высота, диапазон, динамика, темп) аналогичны иерархическим элементам структуры белка.
Total votes 29: ↑27 and ↓2+25
Comments33

Электронный микроскоп обнаружил, как витамин А попадает в клетки

Reading time2 min
Views16K
image

Используя новую, высокоскоростную камеру в паре с электронным микроскопом, ученые Колумбийского университета захватили изображения одного из самых маленьких белков в наших клетках, чтобы «увидеть» его с помощью микроскопа.

Белок, называемый STRA6, находится в мембране наших клеток и отвечает за транспортировку витамина А во внутрь клетки. Витамин А имеет важное значение для всех млекопитающих и имеет особенно важное значение при формировании световых рецепторов в наших глазах во время эмбрионального периода, он имеет решающее значение для нормального развития.

До нового исследования, как STRA6 переносит витамин А в клетку была загадкой. Большинство транспортных белков непосредственно взаимодействуют с веществами, которые они переносят. Но STRA6 взаимодействует с витамином А через посреднический белок, который несет в себе витамин А по крови. Продолжение под катом…
Total votes 20: ↑19 and ↓1+18
Comments10

МЯСО. Правильное питание — мифы и реальность. Часть 2

Reading time11 min
Views37K

Очередная статья про вред мяса, по-вашему? Я постараюсь дать вам не банальную информацию, исследуя взаимодействие красного мяса с нашим организмом. Вы, несомненно, найдёте тут что-то новенькое для себя. Прольём свет на мясной вопрос!

Тех, кому ближе формат видео, приглашаю на мой youtube-канал «Пролить свет». Там вы также найдёте этот материал. Эта статья является продолжением темы мифов правильного питания. Предыдущий материал здесь.

Читать далее
Total votes 45: ↑21 and ↓24-3
Comments72

Клетка VIII. Международные проекты исследования человека

Level of difficultyMedium
Reading time26 min
Views2.3K

Не только интеллектуальные озарения играют важную роль в науке. Такие технические прорывы, как телескоп в астрономии, микроскоп в биологии, спектроскоп в химии, приводят к неожиданным и замечательным открытиям. Вооружившись техническими инструментами, человек получает возможность «видеть» через узенькие окна (видимый и радиодиапазон) с поверхности Земли масштабные миры Вселенной, а с помощью «Хаббла», «Джеймса Уэбба» и «Спектра‑РГ» дополнительно через ультрафиолетовый, инфракрасный и рентгеновский диапазоны из космоса, также через другие окна микроскопов и спектроскопов — видеть микро и нано миры элементарных частиц материи.

Похожую революцию в геномике, протеомике производят сейчас мощные компьютеры, ИИ и информация, содержащаяся в ДНК.

Читать далее
Total votes 4: ↑4 and ↓0+4
Comments5

ГМО-детектор: растение, меняющее цвет в ответ на токсин

Reading time13 min
Views1.1K


У моей бабушки был весьма своеобразный метод проверки степени испорченности продуктов. Если наш кот не ел, что ему на «дегустацию» давала бабушка, значит этот продукт был испорчен и его нельзя было есть и нам. Не самый научный или надежный метод, но в нем все же есть определенная логика. Подобная логика касается и растений, которые способны реагировать на различные химические вещества в воде, почве или воздухе. Ученые из Калифорнийского университета в Риверсайде (США) решили превратить этот природный механизм в биодатчик токсинов, создав растение, которое становится ярко-красное в присутствии определенного токсина в поливе. Какой биологический процесс обеспечивает такую удивительную реакцию, как ученые ее запрограммировали на нужный им токсин, и где можно применить подобную разработку? Ответы на эти вопросы мы найдем в докладе ученых.
Читать дальше →
Total votes 18: ↑16 and ↓2+14
Comments6

Учёные создали фермент, разлагающий пластик за несколько дней

Reading time2 min
Views7.9K

Группа учёных из Техасского университета в Остине создала фермент, способный расщеплять пластик за несколько дней. Получившееся вещество можно потом снова переработать в чистый пластик. 

Читать далее
Total votes 14: ↑14 and ↓0+14
Comments10

Учёные создали математическую модель, по которой возможно перенести производство лекарства на малые орбиты или на МКС

Reading time2 min
Views1.6K

Учёные из Пермского национального исследовательского политехнического университета (ПНИПУ) рассказали о создании математической модели, позволяющей перенести производство лекарства в космос. Исследование опубликовано в журнале «Microgravity Science and Technology».

Читать далее
Total votes 9: ↑7 and ↓2+5
Comments3

Химики УрФУ синтезировали соединения, которые блокируют рост опухолей

Reading time2 min
Views3.7K

Химики Уральского федерального университета разработали соединения, которые способны блокировать рост опухолей. Эти соединения воздействуют на уникальный механизм раковых клеток и подавляют их размножение. Действие соединений изучили на клетках глиобластомы, остеосаркомы и эмбриональной рабдомиосаркомы человека.

Читать далее
Total votes 9: ↑8 and ↓1+7
Comments18

Новосибирские ученые предполагают, что причина агрессии – чрезмерная гибель клеток в мозгу

Reading time1 min
Views12K
В Институте цитологии и генетики предполагают, что агрессивное поведение вызывает чрезмерная гибель нейронов в мозгу. Чтобы это выяснить, ученые исследовали количество белков BDNF и proBDNF в мозгу наиболее и наименее агрессивных крыс, отобранных из 70 поколений.

image
Читать дальше →
Total votes 22: ↑17 and ↓5+12
Comments14

У спящих медведей выделен белок, сохраняющий кости от хрупкости во время зимней спячки

Reading time2 min
Views6K
image
Фото Rachel Cash, Flickr

Группа исследователей из университета Колорадо опубликовала научную работу, посвящённую механизму сохранения костей у чёрных медведей (барибалов) во время их зимней спячки. Практическая сторона работы, помимо чисто биологических и химических вопросов, затрагивает и проблему хрупкости костей скелета космонавтов во время их пребывания в невесомости, а также во время возможных дальних космических полётов. Известно, что в условиях микрогравитации неизбежно происходит вымывание кальция из костей, откуда он попадает в кровь, вызывая гиперкальциемию. Работа опубликована в Journal of Experimental Biology и называется "Suppressed bone remodeling in black bears conserves energy and bone mass during hibernation".
Узнать подробности
Total votes 14: ↑14 and ↓0+14
Comments3

Создан белок для добычи урана из морской воды

Reading time2 min
Views14K


Группа исследователей из Чикагского университета, Пекинского университета и Аргоннской национальной лаборатории спроектировала белковый комплекс, который эффективно связывает растворенный в воде уран. Генетически кодируемая структура рассчитана вычислительными методами, но ее свойства подтвердились экспериментально (статья в Nature Chemistry).

Это первая известная демонстрация, когда для добычи урана из морской воды используется бактериальная система, сконструированная из натуральных белков.
Читать дальше →
Total votes 27: ↑24 and ↓3+21
Comments34

Поделись улыбкою своей … китайские инженеры-генетики создали суперсобаку с удвоенной мышечной массой

Reading time7 min
Views29K
Приветствуем вас на страницах блога iCover! То, что вы видите на фотографии ниже – не плод вашего воспаленного воображения и не результат эксперимента страстного любителя фотошопа. Сегодня это уже наша с вами дополненная реальность и стала она такой благодаря ученым генетикам из института биомедицины и здоровья Гуанчжоу (Guangzhou Institutes of Biomedicine and Health). Именно так выглядит “суперпес”, у которого трансформирован один единственный, но очень важный ген.

О цели эксперимента над братьями нашими меньшими, его результатах и возможных последствиях мы поговорим в этой статье.


Читать дальше →
Total votes 39: ↑36 and ↓3+33
Comments50

Вакцина от малярии стала кандидатом в лекарства от рака

Reading time2 min
Views17K
imageДатские биологи из Копенгагенского университета и Университета Британской Колумбии,
изучая действие, оказываемое вакциной от малярии на организм беременных женщин, случайно обнаружили многообещающее свойство этой вакцины, которое может помочь в борьбе с раком.

Учёные, тестируя вакцину от малярии на людях, по их словам, наткнулись на интересный факт – паразитические малярийные одноклеточные организмы (протисты) цепляются к плаценте точно такими же белками, какие можно встретить в раковых клетках.

«Десятилетиями учёные искали общие признаки у процессов роста плаценты и опухоли. Плацента за несколько месяцев вырастает из нескольких клеток до органа весом в 600-700 гр., функционируя при этом относительно автономно. В каком-то смысле опухоли ведут себя схожим образом»,- утверждает Али Саланти [Ali Salanti] из Департамента иммунологии и микробиологии Копенгагенского университета.

Саланти пояснил, что команде биологов удалось выяснить: и в плаценте, и в опухоли означенный белок отвечает за быстрый рост. В одном из экспериментов малярийный паразит повёл себя с клетками опухоли точно так же, как с плацентой, то есть присоединился к ним.
Читать дальше →
Total votes 29: ↑23 and ↓6+17
Comments15

Метод машинного обучения позволит быстрее проверять новые препараты на эффективность

Reading time2 min
Views1.3K

Исследователи из Института Броуда Массачусетского технологического института и Гарварда представили новый метод машинного обучения DeepBAR, который ускоряет расчеты эффективности связывания молекул лекарств с белками. Именно этот показатель позволяет проверить, будет ли новый препарат работать.

Читать далее
Total votes 6: ↑6 and ↓0+6
Comments0

Исследование: белок в желудке влияет на процесс набора веса

Reading time2 min
Views7.1K

Исследователи из медицинской школы Университета Индианы выяснили, что специфический для желудка белок играет важную роль в прогрессировании ожирения. Это открытие может помочь в разработке терапевтических средств для людей, которые пытаются поддерживать стабильный вес.

Читать далее
Total votes 19: ↑19 and ↓0+19
Comments7

Исследователи создали похожий на кожу материал из белков шелка

Reading time2 min
Views2.3K

Исследователи из инженерной школы Университета Тафтса нашли альтернативу коже с аналогичной текстурой, гибкостью и жесткостью. Они разделили волокна коконов тутового шелкопряда на белковые составляющие, чтобы сформировать из полученных белков подобный коже материал.

Читать далее
Total votes 13: ↑13 and ↓0+13
Comments2

Крестики-нолики: демонстрация управляемого процесса реконфигурации ДНК структур

Reading time11 min
Views4.3K


Ученые провели партию в крестики-нолики с помощью ДНК. Звучит забавно, но это лишь верхушка айсберга притрушенная легким юмором от самих ученых. На самом же деле сегодняшнее исследование раскрывает новые методики контроля кинетики взаимодействия ДНК-наноструктур, которые в совокупности смогут выполнять сложные задачи. Использование ДНК как основных деталей системы — задача не из простых, но это не останавливает ученых, чьи умы полны идей, а сердца энтузиазма. И так, как же им удалось перемещать ДНК-блоки по заданному паттерну, что показало исследование и какие перспективы данной методики в будущем? За ответами обратимся к докладу исследовательской группы. Поехали.
Total votes 17: ↑16 and ↓1+15
Comments0

Трехмерный движок в коде… ДНК

Reading time40 min
Views22K
UPD 29 ноября: Репозиторий с кодом ДНК выложен на GitHub.
github.com/pallada-92/dna-3d-engine

UPD 30 ноября:
В англоязычном твиттере заметили проект
Новость попала в топ-10 на HackerNews!






Меня всегда интересовало, на что может быть похоже программирование внутриклеточных процессов. Как выглядят переменные, условия и циклы? Как вообще можно управлять молекулами, которые просто свободно перемещаются в цитоплазме?

Ответ довольно неожиданный — lingua franca для моделирования сложных процессов в клетках является реакции вида
Эти реакции моделируются при помощи закона действующих масс, который одинаково работает и в химии, и в молекулярной биологии.

— Неужели при помощи этих примитивных реакций можно что-то программировать?
— Да, а то, что написано выше, вычисляет $B = \sqrt{A}$.

В этом пошаговом туториале мы вместе взорвем себе мозг, чтобы получить 10 таких реакций, которые производят рендер трехмерного куба.

Потом я расскажу, как полученные реакции скомпилировать в код ДНК, который можно синтезировать в лаборатории и (если очень повезет) получить трехмерный куб из двумерного массива пробирок.

Как обычно, я сделал веб-приложение с эмулятором таких реакций, в котором можно поупражняться в «реактивном» программировании. Вы сможете удивлять химиков способностью вычисления конечных концентраций в сложных системах реакций методом пристального взгляда.

Для понимания статьи никаких предварительных знаний не требуется, необходимые сведения из школьной программы по биологии мы повторим в начале статьи. Также мы разберем типичные паттерны, которые использует эволюция для достижения сложного поведения в живых клетках.
Total votes 94: ↑94 and ↓0+94
Comments30

Нейросеть AlphaFold предсказала трехмерную структуру всех белков человека

Reading time1 min
Views5K

DeepMind и Европейский институт биоинформатики опубликовали базу данных из более чем 350 тысяч трехмерных белковых структур, которые предсказала нейросеть AlphaFold. ИИ смог определить примерную трехмерную структуру всех 20 тыс. белков, которые синтезируются в клетках человека. 

Читать далее
Total votes 12: ↑12 and ↓0+12
Comments9

Ученые разобрались, как растения реагируют на угрозы

Reading time2 min
Views2.9K

Международная исследовательская группа во главе с Дюссельдорфским университетом имени Генриха Гейне выяснила влияние сигнального механизма и белка MSL10 на возможность растений защищаться от опасностей. Ученые уверены, что тенденция гибели растений от негативных факторов будет усиливаться в результате глобального потепления.

Читать далее
Total votes 12: ↑12 and ↓0+12
Comments4
1