HTML-минимизация в Web Essentials 2013: Что изменилось за год?

Насколько я понял, то это просто несколько файлов, собранных в один. Чтоб модульно верстать, наверное :)

Их можно использовать в SPA-приложениях. Только вам нужно будет самостоятельно обернуть содержимое файлов в именованный контейнер:

<div id="ИМЯ_ФАЙЛА_БЕЗ_РАСШИРЕНИЯ" style="display: none;">…</div>

или

<script type="ТИП_СОДЕРЖИМОГО" id="ИМЯ_ФАЙЛА_БЕЗ_РАСШИРЕНИЯ">…</script>

, где ТИП_СОДЕРЖИМОГО зависит от конкретного фреймворка (например, text/html для KnockoutJS или text/ng-template для AngularJS).