Python
Programming
September 2013 16

Использование памяти в Python

From Sandbox
image

Сколько памяти занимает 1 миллион целых чисел?


Меня часто донимали размышление о том, насколько эффективно Python использует память по сравнению с другими языками программирования. Например, сколько памяти нужно, чтобы работать с 1 миллионом целых чисел? А с тем же количеством строк произвольной длины?
Как оказалось, в Python есть возможность получить необходимую информацию прямо из интерактивной консоли, не обращаясь к исходному коду на C (хотя, для верности, мы туда все таки заглянем).
Удовлетворив любопытство, мы залезем внутрь типов данных и узнаем, на что именно расходуется память.

Все примеры были сделаны в CPython версии 2.7.4 на 32 битной машине. В конце приведена таблица для потребности в памяти на 64 битной машине.

Необходимые инструменты


sys.getsizeof и метод __sizeof__()

Первый инструмент, который нам потребуется находится в стандартной библиотеки sys. Цитируем официальную документацию:

sys.getsizeof(объект[, значение_по_умолчанию])

Возвращает размер объекта в байтах.
Если указано значение по умолчанию, то оно вернется, если объект не предоставляет способа получить размер. В противном случае возникнет исключение TypeError.
Getsizeof() вызывает метод объекта __sizeof__ и добавляет размер дополнительной информации, которая хранится для сборщика мусора, если он используется.


Алгоритм работы getsizeof(), переписанной на Python, мог бы выглядеть следующем образом:
Py_TPFLAGS_HAVE_GC = 1 << 14  # константа. в двоичным виде равна 0b100000000000000
def sys_getsizeof(obj, default = None)        
    if obj.hasattr('__sizeof__'):
        size = obj.__sizeof__()
    elif default is not None:
        return default
    else:
        raise TypeError('Объект не имеет атрибута __sizeof__')
    # Если у типа объекта установлен флаг HAVE_GC
    if type(obj).__flags__ & Py_TPFLAGS_HAVE_GC:
        size = size + размер PyGC_Head
    return size


Где PyGC_Head — элемент двойного связанного списка, который используется сборщиком мусора для обнаружения кольцевых ссылок. В исходном коде он представлен следующей структурой:
typedef union _gc_head {
    struct {
        union _gc_head *gc_next;
        union _gc_head *gc_sourcev;
        Py_ssize_t gc_refs;
    } gc;
    long double dummy;  
} PyGC_Head;


Размер PyGC_Head будет равен 12 байт на 32 битной и 24 байта на 64 битной машине.

Попробуем вызвать getsizeof() в консоли и посмотрим, что получится:
>>> import sys 
>>> GC_FLAG = 1 << 14
>>> sys.getsizeof(1) 
12 
>>> (1).__sizeof__()
12
>>> bool(type(1).__flags__ & GC_FLAG)
False
>>> sys.getsizeof(1.1) 
16 
>>> (1.1).__sizeof__()
16
>>> bool(type(1.1).__flags__ & GC_FLAG)
False
>>> sys.getsizeof('') 
21 
>>> ''.__sizeof__()
21
>>> bool(type('').__flags__ & GC_FLAG)
False
>>> sys.getsizeof('hello') 
26 
>>> sys.getsizeof(tuple()) 
24
>>> tuple().__sizeof__()
12
>>> bool(type(tuple()).__flags__ & GC_FLAG)
True
>>> sys.getsizeof(tuple((1, 2, 3))) 
36


За исключением магии с проверкой флагов, все очень просто.
Как видно из примера, int и float занимают 12 и 16 байт соответственно. Str занимает 21 байт и еще по одному байту на каждый символ содержимого. Пустой кортеж занимает 12 байт, и дополнительно 4 байта на каждый элемент. Для простых типов данных (которые не содержат ссылок на другие объекты, и соответственно, не отслеживаются сборщиком мусора), значение sys.getsizeof равно значению, возвращаемого методом __sizeof__().

id() и ctypes.string_at

Теперь выясним, на что именно расходуется память.
Для этого нужно нам нужны две вещи: во-первых, узнать, где именно хранится объект, а во-вторых, получить прямой доступ на чтение из памяти. Несмотря на то, что Python тщательно оберегает нас от прямого обращения к памяти, это сделать все таки возможно. При этом нужно быть осторожным, так как это может привести к ошибке сегментирования.

Встроенная функция id() возвращает адрес памяти, где храниться начала объекта (сам объект является C структурой)
>>> obj = 1 
>>> id(obj) 
158020320


Чтобы считать данные по адресу памяти нужно воспользоваться функцией string_at из модуля ctypes. Ее официальное описание не очень подробное:
ctypes.string_at(адрес[, длина])
Это функция возвращает строку, с началом в ячейки памяти «адрес». Если «длина» не указана, то считается что строка zero-terminated,


Теперь попробуем считать данные по адресу, который вернул нам id():
>>> import ctypes 
>>> obj = 1 
>>> sys.getsizeof(obj)
12
>>> ctypes.string_at(id(obj), 12) 
'u\x01\x00\x00 \xf2&\x08\x01\x00\x00\x003\x01\x00\x00 \xf2&\x08\x00\x00\x00\x001\x00\x00\x00' 


Вид шестнадцатеричного кода не очень впечатляет, но мы близки к истине.

Модель Struct

Для того чтобы представить вывод в значения, удобные для восприятия, воспользуемся еще одним модулем. Здесь нам поможет функция unpack() из модуля struct.

struct
Этот модуль производит преобразование между значениями Python и структурами на C, представленными в виде строк.

struct.unpack(формат, строка)
Разбирает строку в соответствие с данным форматов. Всегда возвращает кортеж, даже если строка содержит только один элемент. Строка должна содержать в точности то количество информации, как описано форматом.


Форматы данных, которые нам потребуются.
символ Значение C Значение Python Длина на 32битной машине
c char Строка из одного символа 1
i int int 4
l long int 4
L unsigned long int 4
d double float 8


Теперь собираем все вместе и посмотрим на внутреннее устройство некоторых типов данных.

Int

>>> obj = 1
>>> sys.getsizeof(obj), obj.__sizeof__() 
(12, 12) 
>>> struct.unpack('LLl', ctypes.string_at(id(obj), 12)) 
(373, 136770080, 1) 


О формате значений несложно догадаться.

Первое число (373) — количество указателей, на объект.
>>> obj2 = obj
>>> struct.unpack('LLl', ctypes.string_at(id(obj), 12)) 
(374, 136770080, 1) 

Как видно, число увеличилось на единицу, после того как мы создали еще одну ссылку на объект.

Второе число (136770080) — указатель (id) на тип объекта:
>>> type(obj) 
<type 'int'>
>>> id(type(obj) )
136770080


Третье число (1) — непосредственно содержимое объекта.
>>> obj = 1234567 
>>> struct.unpack('LLl', ctypes.string_at(id(obj), 12)) 
(1, 136770080, 1234567)

Наши догадки можно подтвердить, заглянув в исходный код CPython

typedef struct { 
    PyObject_HEAD 
    long ob_ival; 
} PyIntObject;

Здесь PyObject_HEAD — макрос, общий для всех встроенных объектов, а ob_ival — значение типа long. Макрос PyObject_HEAD добавляет счетчик количества указателей на объект и указатель на родительский тип объекта — как раз то, что мы и видели.

Float

Число с плавающей запятой очень похоже на int, но представлено в памяти C значением типа double.
typedef struct { 
    PyObject_HEAD 
    double ob_fval; 
} PyFloatObject;


В этом легко убедиться:
>>> obj = 1.1 
>>> sys.getsizeof(obj), obj.__sizeof__() 
(16, 16) 
>>> struct.unpack('LLd', ctypes.string_at(id(obj), 16) 
(1, 136763968, 1.1) 


Строка (Str)

Строка представлена в виде массива символов, оканчивающимся нулевым байтом. Также в структуре строки отдельного сохраняется ее длина, хэш от ее содержания и флаг, определяющий, хранится ли она во внутреннем кэше interned.

typedef struct { 
    PyObject_VAR_HEAD 
    long ob_shash;   # хэш от строки
    int ob_sstate;  # находится ли в кэше?
    char ob_sval[1];  # содержимое строки  + нулевой байт
} PyStringObject;

Макрос PyObject_VAR_HEAD включает в себя PyObject_HEAD и добавляет значение long ob_ival, в котором хранится длина строки.

>>> obj = 'hello world' 
>>> sys.getsizeof(obj), obj.__sizeof__() 
(32, 32) 
>>> struct.unpack('LLLli' + 'c' * (len(obj) + 1), ctypes.string_at(id(obj), 4*5 + len(obj) + 1)) 
(1, 136790112, 11, -1500746465, 0, 'h', 'e', 'l', 'l', 'o', ' ', 'w', 'o', 'r', 'l', 'd', '\x00') 


Четвертое значение соответствует хэшу от строки, в чем нетрудно убедиться.
>>> hash(obj) 
-1500746465 


Как видно, значение sstate равно 0, так что строка сейчас не кэшируется. Попробуем ее добавить в кэш:
>>> intern(obj) 
'hello world' 
>>> struct.unpack('LLLli' + 'c' * (len(obj) + 1), ctypes.string_at(id(obj), 4*5 + len(obj) + 1)) 
(2, 136790112, 11, -1500746465, 1, 'h', 'e', 'l', 'l', 'o', ' ', 'w', 'o', 'r', 'l', 'd', '\x00') 


Кортеж (Tuple)

Кортеж представлен в виде массива из указателей. Так как его использование может приводить к возникновению кольцевых ссылок, он отслеживается сборщиком мусора, на что расходуется дополнительная память (об этом нам напоминает вызов sys.getsizeof())

Структура tuple похоже на строку, только в ней отсутствуют специальные поля, кроме длины.
typedef struct { 
    PyObject_VAR_HEAD 
    PyObject *ob_item[1]; 
} PyTupleObject;


>>> obj = (1,2,3)
>>> sys.getsizeof(obj), obj.__sizeof__()
(36, 24)
>>> struct.unpack('LLL'+'L'*len(obj), ctypes.string_at(id(obj), 12+4*len(obj)))
(1, 136532800, 3, 146763112, 146763100, 146763088)
>>> for i in obj: print i, id(i)
1 146763112
2 146763100
3 146763088

Как видим из примера, последние три элементы кортежа являются указателями на его содержимое.

Остальные базовые типы данных (unicode, list, dict, set, frozenset) можно исследовать аналогичным образом.

Что в итоге?


Тип Имя в CPython формат Формат, для вложенных объектов Длина на 32bit Длина на 64bit Память для GC*
Int PyIntObject LLl 12 24
float PyFloatObject LLd 16 24
str PyStringObject LLLli+c*(длина+1) 21+длина 37+длина
unicode PyUnicodeObject LLLLlL L*(длина+1) 28+4*длина 52+4*длина
tuple PyTupleObject LLL+L*длина 12+4*длина 24+8*длина Есть
list PyListObject L*5 L*длину 20+4*длина 40+8*длина Есть
Set/
frozenset
PySetObject L*7+(lL)*8+lL LL* длина (<=5 элементов) 100
(>5 элементов) 100+8*длина
(<=5 элементов) 200
(>5 элементов) 200+16*длина
Есть
dict PyDictObject L*7+(lLL)*8 lLL*длина (<=5 элементов) 124
(>5 элементов) 124+12*длина
(<=5 элементов) 248
(>5 элементов) 248+24*длина
Есть
* Добавляет 12 байт на 32 битной машине и 32 байта на 64 битной машине

Мы видим, что простые типы данных в Python в два-три раза больше своих прототипов на C. Разница обусловлена необходимостью хранить количество ссылок на объект и указатель на его тип (содержимое макроса PyObject_HEAD). Частично это компенсируется внутренним кэшированием, который позволяет повторно использовать ранее созданные объекты (это возможно только для неизменяемых типов).

Для строк и кортежей разница не такая значительная — добавляется некоторая постоянная величина.

А списки, словари и множества, как правило, занимают больше на 1/3, чем необходимо. Это обусловлено реализацией алгоритма добавления новых элементов, который приносит в жертву память ради экономии времени процессора.

Итак, отвечаем на вопрос в начале статьи: чтобы сохранить 1 миллион целых чисел нам потребуется 11.4 мегабайт (12*10^6 байт) на сами числа и дополнительно 3.8 мегабайт (12 + 4 + 4*10^6 байт) на кортеж, которых будет хранить на них ссылки.

UPD: Опечатки.
UPD: В подзаголовке «1 миллион целых чисел», вместо «1 миллион простых чисел»
+48
61.1k 285
Comments 30
Top of the day